Z/X: Код воссоединения

После продолжительной и разрушительной войны между человечеством и загадочными зексами, существами, пришедшими из пяти параллельных миров, мир остается в состоянии хрупкого перемирия. Однако на этот раз судьба вселенных лежит на плечах маленькой и хрупкой девочки по имени Адзуми Кагамихара и ее непредсказуемого партнера - хладнокровного зекса по имени Ригель из Голубого Мира.

Чтобы подготовиться к своей ответственной миссии, Адзуми отправляется в Академию Фудзимисаки - специальное учебное заведение, созданное для тренировки и обучения пар, состоящих из человека и зекса. Здесь она знакомится с другими девочками, которые также мечтают стать защитниками миров, и вместе они начинают усердно тренироваться и оттачивать свои навыки. В этой школе Адзуми сталкивается с различными испытаниями, находит верных друзей и обнаруживает силу, которая способна изменить ход судьбы вселенных.