Продолжение аниме-сериала «Парень из эпохи Бакумацу» наступило, и наши герои, Синсаку Такасуги и Когоро Кацура, готовы решить все загадки альтернативной Японии. После долгих поисков они наконец разобрались в запутанной ситуации временных параллелей и с нетерпением ждут возвращения в свое время. Однако, их планы оказываются под угрозой, поскольку разрушенный «хронометр» обретает собственную волю и начинает восстанавливаться. Вопрос в том, как остановить этот процесс, ведь восстановление «хронометра» происходит через опасные разломы, которые привносят в мир различные детали из других времен и наносят огромный урон окружающей среде.
Однако, проблемы не заканчиваются только на восстановлении «хронометра». На горизонте появляется загадочный «законный преемник» Мугэнсая, и его появление становится новой угрозой для наших героев и их попыток вернуться назад. Теперь им предстоит столкнуться с этим таинственным противником и разгадать его намерения, чтобы спасти не только себя, но и весь мир от опасности, которую он представляет. Это будет настоящее испытание для Синсаку Такасуги и Когоро Кацура, которые должны использовать все свои навыки и смекалку, чтобы преодолеть все преграды и достичь своей цели.