Исчезновение Харухи Судзумии

Середина декабря наступает, и Харухи Судзумия, глава бригады SOS, объявляет, что они проведут Рождество в своей клубной комнате, наслаждаясь рождественским ужином. Весь коллектив SOS принимается готовиться к этому празднику. Однако, спустя несколько дней, Кён начинает замечать странности: он не может нормально поговорить с Танигути, который вдруг заболел и не помнит вчерашнего разговора. В классе отсутствует Харухи, а на ее месте сидит ожившая Рёко Асакура, разговаривающая с Кёном, словно ничего не произошло. Кён не узнает Микуру Асахину, а Нагато становится обычной девушкой, единственным членом литературного клуба. В этой школе ни бригады SOS, ни Харухи никогда не существовало...

Таинственные события вокруг Кёна и его одноклассников только усиливаются. Они оказываются в мире, где все, что они знали, и все, что было для них важно, исчезло. Теперь им предстоит раскрыть тайну этого загадочного мира и найти способ вернуться в реальность. С каждым шагом они сталкиваются с новыми загадками, которые постепенно раскрывают истину о прошлом и настоящем. Время и пространство переплетаются, а друзьям придется принять сложные решения, чтобы спасти себя и вернуть все обратно, как было прежде...