Евангелион нового поколения: Конец Евангелиона

После сокрушительной победы над последним Ангелом, организации Nerv неожиданно появляется новый враг - люди, объединенные под руководством загадочной организации Seele. Главным героем оказывается Синдзи Икари, молодой человек, погруженный в глубокую депрессию и нерешительность. Перед ним стоит нелегкий выбор: принять человечество со всеми его недостатками или отказаться от индивидуальности и стать частью вселенского сознания.

Параллельно Синдзи борется с личными демонами, командующий Nerv - его отец Гэндо Икари, готовится осуществить свою долгожданную мечту о совершенстве человечества. Он использует загадочную Рей Аянами и Лилит, чтобы достичь своей цели. В это время над миром нависает опасность, и наступает момент истины. Финальная битва, которая решит судьбу человечества и всего мира, неотвратимо приближается.